Le département de la Charente compte 16 sites Natura 2000 pour environ 47 766 hectares, soit 8 % de son territoire.
3 Zones de Protection Spéciales (ZPS) ont été désignées au titre de la directive "Oiseaux", pour une superficie d'environ 21 660 hectares.
13 Zones Spéciales de Conservation (ZSC) ont été désignées au titre de la directive "Habitats, Faune, Flore", pour une superficie d'environ 26 106 hectares.
8 sites sont interdépartementaux et sont gérés par les départements limitrophes : Charente-Maritime, Gironde, Dordogne, Vienne.